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ContigExpress(序列拼接結(jié)果驗證工具)

v3.0.0 綠色版

ContigExpress(序列拼接結(jié)果驗證工具)下載
  • 軟件大?。?span itemprop="fileSize">1.01 MB
  • 軟件語言：中文
  • 軟件類型：國產(chǎn)軟件 / 其他行業(yè)
  • 軟件授權(quán)： 免費軟件
  • 更新時間：2016-12-21 10:20:03
  • 軟件等級：4星
  • 軟件廠商： -
  • 應(yīng)用平臺：WinAll, WinXP
  • 軟件官網(wǎng)：

ITMOP本地下載文件大?。?.01 MB

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小編為您推薦： ContigExpress 序列拼接

ContigExpress是一款專業(yè)的測序結(jié)果的序列拼接軟件,是可以幫助生物研究的朋友們更加方便的測量序列.有需要的朋友就來IT貓撲下載吧!

軟件簡介

由于一般測序方法的限制，測續(xù)結(jié)果一般只能到800bp左右，所以對于較長片段只能用不同引物測序后根據(jù)結(jié)果拼接，ContigExpress正是一款非常實用的序列拼接軟件。

使用方法

解壓縮下載的壓縮文件contig.zip文件，保證文件CExpress.exe,Gexudat.def在同一個目錄下，打開Cexpress.exe應(yīng)用程序，進入ContigExpress操作界面

ContigExpress

點擊菜單上的“Project”選擇“Add Fragments”，一般我們發(fā)給您的是AB1文件，如果您有其它格式的文件，也可以選擇，在這里我們選擇AB1文件，以其為例

ContigExpress

選擇您存放AB1文件（即我們Email給您的測序結(jié)果的彩圖文件）的目錄，選擇文件類型為ALL FILES, 之后打開要拼接的AB1，從而添加進ContigExpress軟件。在此以A、B兩個序列為例，如果有多個序列的也可以同時添加進入。

ContigExpress

選中要拼接的序列，再選菜單 “Assemble”欄下的“Assemble Selected Fragments”命令，或用工具欄上的按鈕，如圖3。若兩個結(jié)果能夠拼接起來的，會得到一個Assemble1下的contig1的結(jié)果

ContigExpress

雙擊contig1，打開拼接后的結(jié)果，選中菜單“VIEW”欄，進入VIEW OPTION，將SHOW ALIGNMENT AS 由 TEXT 改為 GRAPH.，點擊OK后得到結(jié)果如圖5。此時可能會因為兩條序列的測序結(jié)果誤差，會有不同的地方，在拼接圖片框中的綠色豎杠就表示了這些不同的地方。接著可點擊綠色豎杠找到有誤差的地方，進行修改。

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